Descripci贸n del proyecto

Curso Online

Curso sobre Bioconductor avanzado

Visi贸n general del curso sobre Bioconductor avanzado

En este curso, comenzamos con enfoques para la visualizaci贸n de datos a escala del genoma y brindamos herramientas para construir interfaces gr谩ficas interactivas para acelerar el descubrimiento y la interpretaci贸n.

Usando knitr y markdown como herramientas b谩sicas de autor铆a, se desarrolla el concepto de investigaci贸n reproducible y se presenta el concepto de documento ejecutable.

En este marco, los informes est谩n estrechamente vinculados con los datos y el c贸digo subyacentes, lo que mejora la reproducibilidad y la extensibilidad de los an谩lisis completados.

Estudiamos enfoques sin memoria para el an谩lisis de recursos de datos muy grandes, utilizando bases de datos relacionales o HDF5 como 芦back-end禄 con interfaces R familiares.

La integraci贸n de datos mult贸 micos se ilustra utilizando una versi贸n curada de The Cancer Genome Atlas. Finalmente, exploramos los recursos residentes en la nube desarrollados para la Enciclopedia de elementos de ADN (el proyecto ENCODE). Estos abordan la uni贸n del factor de transcripci贸n, ATAC-seq y RNA-seq con interferencia CRISPR.

Dada la diversidad en la formaci贸n educativa de nuestros estudiantes, hemos dividido la serie en siete partes. Puede tomar toda la serie o cursos individuales que le interesen.

Si usted es estad铆stico, debe considerar omitir los primeros dos o tres cursos, de manera similar, si son bi贸logos, deber铆a considerar omitir algunas de las conferencias introductorias de biolog铆a.

Tenga en cuenta que los aspectos de estad铆stica y programaci贸n de la clase aumentan en dificultad relativamente r谩pido en los primeros tres cursos.

En el tercer curso, se ense帽ar谩 conceptos estad铆sticos avanzado, como modelos jer谩rquicos, y en el cuarto, habilidades avanzadas de ingenier铆a de software, como computaci贸n paralela y conceptos de investigaci贸n reproducibles.

Estos cursos conforman dos Certificados Profesionales y son a su propio ritmo:

An谩lisis de datos para ciencias de la vida:

  • PH525.1x: Estad铆stica y R para las ciencias de la vida
  • PH525.2x: Introducci贸n a modelos lineales y 谩lgebra matricial
  • PH525.3x: Inferencia estad铆stica y modelado para experimentos de alto rendimiento
  • PH525.4x: An谩lisis de datos de alta dimensi贸n

An谩lisis de datos gen贸micos:

  • PH525.5x: Introducci贸n al bioconductor
  • PH525.6x: estudios de caso en gen贸mica funcional
  • PH525.7x: bioconductor avanzado

Esta clase fue apoyada en parte por NIH Grant R25GM114818.

HarvardX requiere que las personas que se inscriban en sus cursos cumplan con los t茅rminos del c贸digo de honor. HarvardX tomar谩 las medidas correctivas apropiadas en respuesta a las violaciones del c贸digo de honor, que pueden incluir el despido del curso de HarvardX; revocaci贸n de cualquier certificado recibido para el curso HarvardX; u otros remedios seg煤n lo ameriten las circunstancias. No se emitir谩n reembolsos en caso de acci贸n correctiva por tales violaciones. Los inscritos que toman cursos de HarvardX como parte de otro programa tambi茅n se regir谩n por las pol铆ticas acad茅micas de esos programas.

HarvardX persigue la ciencia del aprendizaje. Al registrarse como aprendiz en l铆nea en un curso de HX, tambi茅n participar谩 en investigaciones sobre el aprendizaje. Lea nuestra declaraci贸n de investigaci贸n para obtener m谩s informaci贸n.

La Universidad de Harvard y HarvardX se comprometen a mantener un ambiente educativo y laboral seguro y saludable en el que ning煤n miembro de la comunidad est茅 excluido de la participaci贸n, se le nieguen los beneficios o sea objeto de discriminaci贸n o acoso en nuestro programa. Se espera que todos los miembros de la comunidad de HarvardX acaten las pol铆ticas de Harvard sobre no discriminaci贸n, incluido el acoso sexual, y los t茅rminos de servicio. Si tiene alguna pregunta o inquietud, comun铆quese con harvardx@harvard.edu y / o informe su experiencia a trav茅s del formulario de contacto.

Lo que aprender谩s en este curso

  • Visualizaci贸n est谩tica e interactiva de datos gen贸micos.
  • M茅todos de an谩lisis reproducibles.
  • Representaciones que ahorran memoria de ensayos gen贸micos
  • Trabajando con experimentos mult贸micos en c谩ncer
  • Interrogaci贸n dirigida de archivos gen贸micos a escala de nubes

Curso Online sobre Bioconductor avanzado. Inscribete ya!

  • Instituci贸n: Harvard
  • Costo: Gratis
  • Certificado: Incluye
  • Modalidad: Online
  • Inicio: Ver Fechas
  • Duraci贸n: 5 semanas
  • Dedicaci贸n: 2 a 4 horas por semana
  • Idioma: Ingl茅s
  • Subt铆tulos: Ingl茅s
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