Descripci贸n del proyecto

Curso Online

Curso sobre Estudios de casos en gen贸mica funcional

Visi贸n general del curso sobre Estudios de casos en gen贸mica funcional

Explicaremos c贸mo realizar los pasos est谩ndar de procesamiento y normalizaci贸n, comenzando con datos sin procesar, para llegar al punto en el que uno pueda investigar preguntas biol贸gicas relevantes. A lo largo de los estudios de caso, haremos uso de gr谩ficos exploratorios para obtener una visi贸n general de la forma de los datos y el resultado del experimento.

Comenzamos con el an谩lisis de datos de RNA-seq que cubre conceptos b谩sicos y un primer vistazo a los archivos FASTQ. Tambi茅n revisaremos el control de calidad de los archivos FASTQ; alineando lecturas de ARN-seq; visualizar alineaciones y pasar a analizar RNA-seq a nivel gen茅tico: contar lecturas en genes; An谩lisis exploratorio de datos y estabilizaci贸n de varianza para recuentos; expresi贸n diferencial basada en conteo; normalizaci贸n y efectos por lotes.

Finalmente, cubrimos la secuencia de ARN a nivel de transcripci贸n: inferir la expresi贸n de transcripciones (es decir, isoformas alternativas); Uso diferencial de ex贸n. Aprenderemos los pasos b谩sicos para analizar los datos de metilaci贸n del ADN, incluida la lectura de los datos en bruto, la normalizaci贸n y la b煤squeda de regiones de metilaci贸n diferencial en varias muestras.

El curso finalizar谩 con una breve descripci贸n de los pasos b谩sicos para analizar los conjuntos de datos ChIP-seq, desde la alineaci贸n de lectura hasta la llamada de pico, y evaluar los patrones de enlace diferencial a trav茅s de m煤ltiples muestras.

Dada la diversidad en la formaci贸n educativa de nuestros estudiantes, hemos dividido la serie en siete partes. Puede tomar toda la serie o cursos individuales que le interesen.

Si usted es estad铆stico, debe considerar omitir los primeros dos o tres cursos, de manera similar, si son bi贸logos, deber铆a considerar omitir algunas de las conferencias introductorias de biolog铆a.

Tenga en cuenta que los aspectos de estad铆stica y programaci贸n de la clase aumentan en dificultad relativamente r谩pido en los primeros tres cursos.

En el tercer curso, se ense帽ar谩n conceptos estad铆sticos avanzados, como modelos jer谩rquicos, y en el cuarto, habilidades avanzadas de ingenier铆a de software, como computaci贸n paralela y conceptos de investigaci贸n reproducibles.

Estos cursos conforman dos Certificados Profesionales y son a su propio ritmo:

An谩lisis de datos para ciencias de la vida:

  • PH525.1x: Estad铆stica y R para las ciencias de la vida
  • PH525.2x: Introducci贸n a modelos lineales y 谩lgebra matricial
  • PH525.3x: Inferencia estad铆stica y modelado para experimentos de alto rendimiento
  • PH525.4x: An谩lisis de datos de alta dimensi贸n

An谩lisis de datos gen贸micos:

  • PH525.5x: Introducci贸n al bioconductor
  • PH525.6x: estudios de caso en gen贸mica funcional
  • PH525.7x: bioconductor avanzado

Esta clase fue apoyada en parte por NIH Grant R25GM114818.

HarvardX requiere que las personas que se inscriban en sus cursos en edX cumplan con los t茅rminos del c贸digo de honor. HarvardX tomar谩 las medidas correctivas apropiadas en respuesta a las violaciones del c贸digo de honor, que pueden incluir el despido del curso de HarvardX; revocaci贸n de cualquier certificado recibido para el curso HarvardX; u otros remedios seg煤n lo ameriten las circunstancias. No se emitir谩n reembolsos en caso de acci贸n correctiva por tales violaciones. Los inscritos que toman cursos de HarvardX como parte de otro programa tambi茅n se regir谩n por las pol铆ticas acad茅micas de esos programas.

HarvardX persigue la ciencia del aprendizaje. Al registrarse como aprendiz en l铆nea en un curso de HX, tambi茅n participar谩 en investigaciones sobre el aprendizaje. Lea nuestra declaraci贸n de investigaci贸n para obtener m谩s informaci贸n.

La Universidad de Harvard y HarvardX se comprometen a mantener un ambiente educativo y laboral seguro y saludable en el que ning煤n miembro de la comunidad est茅 excluido de la participaci贸n, se le nieguen los beneficios o sea objeto de discriminaci贸n o acoso en nuestro programa. Se espera que todos los miembros de la comunidad de HarvardX acaten las pol铆ticas de Harvard sobre no discriminaci贸n, incluido el acoso sexual, y los T茅rminos de servicio. Si tiene alguna pregunta o inquietud, comun铆quese con harvardx@harvard.edu y / o informe su experiencia a trav茅s del formulario de contacto.

Lo que aprender谩s en este curso

  • Lecturas de mapeo
  • Evaluaci贸n de calidad de los datos de la pr贸xima generaci贸n.
  • Analizando datos de RNA-seq
  • Analizando datos de metilaci贸n de ADN
  • Analizando datos de ChIP Seq

Curso Online sobre Estudios de casos en gen贸mica funcional

  • Instituci贸n: Harvard
  • Costo: Gratis
  • Certificado: Incluye
  • Modalidad: Online
  • Inicio: Ver Fechas
  • Duraci贸n: 5 semanas
  • Dedicaci贸n: 2 a 4 horas por semana
  • Idioma: Ingl茅s
  • Subt铆tulos: Ingl茅s
  • Ir al curso

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