Descripci贸n del proyecto

Curso Online

Curso sobre Simulaci贸n Neurociencia

Visi贸n general del curso sobre Simulaci贸n Neurociencia

Simulaci贸n Neurociencia es un enfoque emergente para integrar el conocimiento disperso en todo el campo de la neurociencia.

El objetivo es construir una imagen emp铆rica unificada del cerebro, para estudiar los mecanismos biol贸gicos de la funci贸n cerebral, el comportamiento y la enfermedad. Esto se logra integrando diversas fuentes de datos a trav茅s de las diversas escalas de neurociencia experimental, desde molecular hasta cl铆nica, en simulaciones por computadora.

Este es un curso 煤nico en l铆nea abierto y masivo impartido por un equipo multidisciplinario de cient铆ficos de renombre mundial. En este primer curso, obtendr谩 el conocimiento y las habilidades necesarias para crear simulaciones de neuronas biol贸gicas y sinapsis.

Este curso es parte de una serie de tres cursos, donde aprender谩 a usar, herramientas de modelado de 煤ltima generaci贸n de la Plataforma de simulaci贸n cerebral HBP para simular neuronas, construir redes neuronales y realizar sus propios experimentos de simulaci贸n.

隆Te invitamos a unirte a nosotros y compartir nuestra pasi贸n por reconstruir, simular y comprender el cerebro!

Lo que aprender谩s en este curso

  • Discutir los diferentes tipos de datos para la neurociencia de simulaci贸n.
  • C贸mo recopilar, anotar y registrar diferentes tipos de datos de neurociencia
  • Describir las estrategias de simulaci贸n de neurociencia.
  • Clasificar diferentes caracter铆sticas de clasificaci贸n de las neuronas
  • Enumerar diferentes caracter铆sticas de sinapsis y aspectos de comportamiento.
  • Modele una neurona con todas sus partes (soma, dendritas, ax贸n, sinaps) y su comportamiento
  • Usar datos experimentales sobre la actividad neuronal para restringir un modelo.

Plan de estudio del curso

Semana 1: Neurociencia de simulaci贸n: una introducci贸n,

Entendiendo el cerebro

  • Enfoques y justificaci贸n de la neurociencia de simulaci贸n
  • Los principios de la neurociencia de simulaci贸n.
  • Estrategias de datos
  • Neuroinform谩tica
  • Estrategias de reconstrucci贸n y simulaci贸n.
  • Resumen y advertencias Datos experimentales
  • T茅cnicas de recolecci贸n de datos de neuronas individuales
  • Perfiles morfol贸gicos
  • Perfiles electrofisiol贸gicos
  • Advertencias y resumen de las t茅cnicas de datos experimentales. Datos de neuronas individuales
  • Canales i贸nicos
  • Combinando perfiles
  • Densidades celulares
  • Resumen y advertencias
  • Sinapsis
  • Din谩mica sin谩ptica

Semana 2: neuroinform谩tica

Introducci贸n a la neuroinform谩tica

  • Extracci贸n de textos
  • Integraci贸n de datos y gr谩ficos de conocimiento
  • Gr谩ficos de conocimiento
  • Ontolog铆as
  • Neuroinform谩tica
  • Atlas cerebral y espacio de conocimiento
  • Motivaci贸n de la integraci贸n de datos.
  • Enfoque de datos fijos para la integraci贸n de datos
  • Nexo cerebral azul
  • Arquitectura del Nexo Cerebro Azul
  • Dise帽ar una entidad de procedencia
  • Ontolog铆as
  • Creando tu propio dominio
  • MENTES
  • Conclusi贸n
  • Adquisici贸n de datos de electrofisiolog铆a y morfolog铆a neuronales.
  • Generando datos
  • Usando datos
  • Dise帽ar una entidad
  • El dise帽o de una entidad y el modelo de procedencia.
  • Conclusi贸n
  • Extracci贸n de caracter铆sticas morfol贸gicas
  • Estructuras morfol贸gicas,
  • Comprender las morfolog铆as neuronales con NeuroM
  • Estad铆sticas y visualizaci贸n de datos morfom茅tricos.

Semana 3: modelado de neuronas

Introducci贸n a la neurona individual

  • Introducci贸n
  • Motivaci贸n para estudiar el cerebro el茅ctrico.
  • La neurona
  • Una introducci贸n estructural
  • Un dispositivo el茅ctrico
  • Modelo de neurona el茅ctrica
  • Modelando la actividad el茅ctrica
  • Hodgkin y Huxley
  • Tutorial de creaci贸n de modelos el茅ctricos de celda 煤nica.
  • Modelo el茅ctrico de celda 煤nica: pasivo
  • Haci茅ndolo activo
  • Agregar una dendrita
  • C茅lulas de conexi贸n

Semana 4: Sinapsis de modelado

Modelando el potencial sin谩ptico

  • Modelando el potencial
  • Modelo de cable de Rall
  • Modelado de transmisi贸n sin谩ptica entre neuronas
  • Transmisi贸n sin谩ptica
  • Modelado de transmisi贸n sin谩ptica
  • Tutorial de modelado de sinapsis din谩micas
  • Definiendo tus sinaps
  • Compilando tus modificaciones
  • Hospedaje y prueba de su modelo de sinaps
  • Reconfigura tus sinaps en rangos biol贸gicos
  • Definir un modfile para una sinapsis din谩mica de TM
  • Compilar y probar el mod file

Semana 5: modelos de neuronas restrictivas con datos experimentales

Restringir los modelos neuronales con datos experimentales

  • Modelo de neurona restrictiva con datos experimentales.
  • Aspectos computacionales de la optimizaci贸n.
  • Herramientas para restringir los modelos neuronales.
  • Tutoriales para optimizaci贸n
  • Configurar los componentes

Semana 6: semana de ex谩menes

Portal de NMC

  • Accediendo al portal NMC
  • Ejecutar modelos en su computadora local
  • Descargar e interactuar con los modelos de celda 煤nica
  • Inyectando una corriente

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